潛意識不是單一、混沌的黑箱，而是具有結構、層次與目的性的心理系統。榮格認為潛意識不是意識的敵人，而是補償與引導意識的智慧來源。
來源為個人生命經驗稱為個人潛意識(Personal Unconscious)，與自我直接關聯，主要潛意識原型為陰影。
- 被遺忘的記憶
- 被壓抑的情緒與衝動
- 未被發展的人格潛能
- 不被自我認可的特質，形成「陰影」
以群體文化經驗稱為集體潛意識(Collective Unconscious)，這是榮格最具革命性的發現。集體潛意識不是來自個人經驗，而是人類共同繼承的心理文化結構，來源為人類過去的演化與文化記憶，時常有跨文化、跨時代的特性，是無法學習只能被喚醒的狀態。
- 集體潛意識會反覆於神話、宗教、夢中出現的象徵意義。
- 人類共通的情感與行為模式
榮格認為潛意識不只是「被壓抑的過去」，而是指向「未來」的心理系統。當自我過度偏向某一方向，潛意識會用夢或症狀「拉回平衡」，因為現實的集權壓抑狀態，自我會選擇忽略或否認的真實現象，潛意識則會反向的思考，揭露並且平衡，提供尚未實現的可能性，其個體化的發展方向。